台北地檢署日前偵辦前行政院國會聯絡人胡鵬年及台商鄭明嘉共諜案，意外發現案外案。朱政騏曾於2022年收受胡鵬年交寄1隻iPhone 13 pro手機，在擔任立委何志偉及議員鍾佩玲聯合服務處助理期間，出入立法院立委辦公室，刺探、收集列為「密件」的文件資料，並回傳中國統戰單位外圍組織。檢方今依違反《國家安全法》起訴。求刑5年以上，並沒收犯罪所得人民幣2萬元。
關於傳送的公文內容，朱政騏中午出面說明表示，他傳的公文內2022年8月有美國參議員馬基來台訪問，當時媒體已有很多公開報導，但因傳的第一張公文有寫「如附件請查照」，上面有個「密」字，檢察官認定有洩密問題。他也支持要嚴格執行《國安法》，所以對檢方起訴沒有意見，但他會在法庭上自證清白。
被問到是否收受2萬元人民幣，朱政騏強調絕對沒有收受任何現金或報酬，並說這其實是「家事糾紛」。他的岳父娶了陸配，來台3年還沒拿到身分證，在岳父過世後，該陸配不斷索討各種費用，又找很多人對他施壓，還稱來台灣「又不是真的來結婚的，就是來賺錢的」。他就找了一個之前的駐台記者、陸配的福建同鄉幫忙溝通，後來據稱這個駐台記者給了陸配2萬元人民幣。
朱政騏還說，該陸配告上法院，他和太太後續和解，把不動產、遺產分她一半，才沒有繼續在鬧。這件事情一直拖到2023年還在鬧，當時一直在處理這件事情。
對於「綠色友誼連線」少主、總統府副秘書長何志偉發出聲明譴責，朱政騏說，這確實就是一個家事糾紛，何並不了解個案內容，可能不太清楚。他尊重何的看法，他們團隊一向對行為操守有非常嚴格要求。
朱政騏3月初剛剛在民進黨台北市議員黨內民調中出線，甫獲提名資格，但爆發共諜案，遭民進黨台北市黨部開除黨籍。
朱政騏說，希望市黨部可以給他一個說明的機會，因為今天市黨部並沒有邀他說明，但他會充分尊重市黨部的決定，因為他自己也是市黨部出身，當過市黨部執行長。被問到是否脫黨參選？他說，民進黨要團結，他絕對不會脫黨參選。
