根據巴勒斯坦相關組織「巴勒斯坦之心」在社群平台的說法，船隊一名高層成員、亦為指導委員會成員，被指在航行期間與3名志願者發生不當關係，並質疑其涉及權力不對等問題。該組織認為，相關行為若屬實，可能違反人道行動中應有的倫理規範。
部分社群帳號與評論者亦在網路上點名巴西活動人士蒂亞戈·艾維拉（Thiago Ávila）與相關事件有所關聯，並引發輿論擴散，不過這些說法目前主要來自社群媒體與非正式來源。
先前39歲的艾維拉就於6月時乘坐可容納12人的瑪德琳號前往加薩，在那裡他和另一位活動家桑伯格擺出了許多親密的姿勢拍照，兩人互相摟著肩膀，興高采烈地看著對方，之後他們最終被以色列軍隊拘留並驅逐出境。
對此，艾維拉本人已否認相關指控，並表示所謂事件「並不屬實」。他指出，船隊內部的道德委員會曾與相關人士溝通，並未發現任何不當行為證據，認為相關指控屬於抹黑。他同時強調，相關成員之間的互動屬於長期友誼與正常共事關係。
一名同船的女性志願者亦透過社群平台回應，否認外界傳言，並表示船上文化中存在密切互動與共處空間，但不代表存在不當行為。
據報導，該船隊隸屬或與「Freedom Flotilla Coalition」及「Global Sumud」相關行動有聯繫，近期目標之一為向加薩地區運送援助物資並募款支持人道行動，不過外界對其募資透明度及實際成效亦存在質疑。
此外，有批評者指出，船隊活動過程中包含音樂活動與社交元素，質疑其行動嚴肅性。支持者則反駁，認為相關描述被誇大，並強調其主要目的是推動人道援助與關注加薩局勢。目前船隊方面表示已設立內部機制處理類似爭議，並強調將持續審查所有相關投訴。
