檢方指控，柯文哲收受威京集團主席沈慶京1710萬元，與其進行多次密會後，同意將京華城公司回覆樓地板面積的陳情案，送進都委會研議，涉嫌圖利京華城等公司高達121億545萬6748元之不法利益。
柯文哲還被指控，侵占基隆市副市長邱佩琳募款、捐贈給民眾黨的600萬元政治獻金；此外，他也涉嫌將肖像權授權給木可公司，由競選總部推出捐款換小物的活動對外募款，再以收取授權費名義將募得的政治獻金轉入木可公司帳戶，以此手法規避政治獻金用途的種種限制，成功侵占6234萬餘元的政治獻金。
檢方去年12月26日依貪汙治罪條例違背職務收賄、圖利、公益侵占、背信等罪起訴柯文哲，並求處28年6月有期徒刑。
面對諸多指控，柯文哲矢口否認犯罪，屢次在開庭時批檢調為政治打手，更否認行動硬碟內「工作簿」檔案中的「小沈、1500」就是收賄款項，強調「沒有圖利、貪污、公益侵占」。
合議庭今將傳喚威京集團主席沈慶京、台北市議員應曉薇、柯辦前主任李文宗、前木可公關公司負責人李文娟、精華會計師事務所會計師端木正進行詰問，值得注意的是，這5名被告目前無人認罪，他們在法庭上會如何與柯文哲互動，勢必為本案掀起一番輿論。
