面對外界關切與吳釗燮關係是否真的不合？林佳龍今天上午接受節目專訪時表示，「我跟吳釗燮很好，就私交啦」，在公務上能分工合作，而外交部跟國安會在憲政體制上有各自角色，他是一個政治學者，有很多實務經驗。所以他理想中的外交部就是要強化角色，如外館如何去落實館長制、府院除了國安會外，還有行政院經濟外交工作小組等，「所以我們建立制度，就事論事」。
林佳龍也提到，自己和總統賴清德的關係就是秉持賴施政的理念，壯大台灣外交，外交部的角色跟功能要發揮得更好，其他部會或單位也會發揮得更好。所以在遇到事情時，還是要回到制度面。大家都是長期很有合作的經驗，但是遇到事情時的角色分工，大家要多討論。
林佳龍說，外界有些扭曲、誤導的地方，也希望不要太過誇大，變成人跟人的問題，這是制度面的問題，怎麼讓台灣的外交發揮更大，他相信外交部跟國安會都是在總統領導之下，一個分工合作的關係。
林佳龍進一步說，他跟吳釗燮的工作有時會互相調換，就像他在國安會服務過、現在擔任外交部長，吳釗燮也一樣，他們在總統府也都擔任過秘書長、副秘書長，「所以我們是很熟識的朋友」。在公務上，國安會跟外交部也是一個團隊，所以就做好分工合作。
林佳龍說，他們一個簡訊就可以溝通，且2人在群組幾乎隨時一起打仗。所以外界有一些扭曲錯誤的報導，外交部跟國安會也都做了澄清，所以請大家不要再去擴散，這對台灣的外交上也會有傷害。
林佳龍表示，其實在賴總統主政這一年半的時間，在外交工作上是有很多的發展，這也是國安團隊一起促成的，他強調雙方未來將持續合作，捍衛台灣的國家利益。
