3月25日下午4時，海巡署南部分署於曾文溪口西方5.8浬海域偵測到目標，4時35分，守望人員抵達現場時，僅見一艘搭載舷外機的動力小艇停在沙灘，船上空無一人。海巡隨即扣押小艇，並與警方啟動岸際搜索，報請台南地檢署指揮偵辦。
專案小組透過船上留下的跡證及相關事證，鎖定李男行蹤。李男在18年前因涉嫌改造槍砲未到案，遭新北地檢署發布通緝，他在通緝前搭機前往大陸。李男供稱，因通緝令未撤銷，且正值清明節，才決定從大陸沿海駕駛小艇直抵台灣。
海巡署表示，當時海象平穩，若油料充足，小艇可從大陸沿海直衝台南，但目前仍不排除有母船接應。李男成功登陸後潛逃北上，在台躲藏10天後才落網，這段期間的行蹤及是否有內應成為調查重點。
此案件再度引發外界對海岸防衛能力的質疑。海巡署南部分署對此保持低調，表示為保全證據已帶回小艇保管，正深入調查背後的支援網絡。近年小艇闖關事件頻發，包括2024年6月大陸籍阮男駕快艇衝進淡水河口。這次李男避開偵查成功登陸並潛逃多日，相關單位正檢討防禦漏洞。
