賈永婕14日身穿黑色洋裝、白色短外套到立院備詢，沒想到遭到民進黨立委賴惠員質疑，更出言建議要賈永婕穿得跟其他人一樣「純樸」，還說國會殿堂有一定的標準。賈永婕則回應，「我穿得跟你們一樣，一樣是長袖」；賴惠員則再度表示，「要繼續辯嗎？」
相關畫面在網路上曝光後，賴惠員遭到網友抨擊；事後，賴惠員緊急發布新聞稿澄清，認為賈永婕將外套披在肩上的方式，應該考量到國會議事殿堂的正式性才會提醒，強調絕無針對個人風格、服裝品味的批評；然而，網友並不買帳，賴惠員緊接著二度發聲道歉，表示回看影片發現確實不妥當，整件事情也造成賈董事長、社會大眾的不舒服，本人深感不安，也深刻檢討。
這次事件引發網友討論，更有人挖出賴惠員過往的爭議，維基百科的資料也被網友修改，被加上「很愛給人下馬威」等文字。有網友列出過往的5大爭議，包含抹紅言論被控誹謗、攔截競選文宣車、波波醫修法、波波醫言論，以及論文抄襲等。
抹紅言論被控誹謗：2019年賴惠員上政論節目影射當時參加競選台南市立委補選的無黨籍候選人陳筱諭是中共在操盤，引來陳筱諭不滿，並向台南地檢署提告；官司經過3年審理，原一審判4個月徒刑並褫奪公權1年，賴惠員不服上訴後，在二審宣判前，了解到自己造成陳筱諭及其家人傷害，向陳筱諭認錯並和解，請求無罪判決，後二審改判無罪。
攔截競選文宣車：2019年台南市第一選區的立委選舉競爭激烈，由賴惠員對上國民黨蔡育輝，當時賴惠員在東山區指控蔡育輝發送塑膠便當盒文宣品涉嫌賄選，帶人攔下整輛車，請助理蒐證後報請檢調處理。蔡育輝則表示，便當盒是證件要發的文宣品，每個成本15元，沒有超過30元，而賴惠員的人攔住物資車，涉嫌妨害自由，雙方互相喊告。
波波醫修法：2022年立院3讀通過《醫師法》修正案，明定持國外醫學學歷報考國內醫師考試者的學歷甄試要件及實習規定，在黨團協商時，包含賴惠員在內的多位立委提案夾帶7項附帶決議也一併通過，但內容都是有利國外學歷畢業生，而賴惠員遭揭發女兒在波蘭讀牙醫，被質疑在立法過程未遵守利益迴避原則。
波波醫言論：賴惠員在臉書聲援「波波牙醫」，還拿出白色恐怖時期「海外黑名單」與外國學歷牙醫系學生作為類比，遭到本土醫學院學生與醫師痛斥批評。先前揭露賴惠員女兒在波蘭讀牙醫系的民進黨籍立委擬參選人郭貞慧（前台南市觀旅局長），譴責賴惠員沒有民主意識和台灣本土概念，完全對不起白色恐怖的受難者及其家屬，以及海外流亡的黑名單民主前輩。
論文抄襲疑雲：2023年5月國民黨台北市議員徐巧芯等人指控賴惠員的中正大學政治所碩士論文涉嫌抄襲同校高生的學位論文；同年8月，新黨立委候選人游智彬指控賴惠員碩士論文不僅抄襲同校高姓學生學位論文，也抄襲東海大學劉姓學生的碩士論文。同年9月，中正大學認定論文引注有瑕疵，要求賴惠員於限期內修改補正。
