根據《菱傳媒》官網介紹,創刊後的第1套調查報導「台中105號碼頭」案,揭發台中黑派掌門人、鎮瀾宮董事長顏清標2020年1月與台中紅派代表、台中市議會前議長張清堂合作,兩家聯手奪下台中港105號碼頭20年經營權,粗估20年營業額可望超過100億元台幣。
該系列報導調查105號碼頭如何從公用到民營「華麗轉身」,揭露顏寬恒多次在立法院利用立委身分院質詢、提案關切此案的發言內容,並同步揭露顏家橫跨砂石瀝青與營造業的驚人事業版圖。
報導出爐時因適逢台中第2選區立委補選,除為選情投下震撼彈,也因迫使官方正視問題收回105號碼頭經營權,獲得重大迴響而入圍當年度的卓越新聞獎,但最後並未獲獎。
另一篇被《菱傳媒》社長陳申青證實來源與黃國昌有關的報導,則是2022年11月首期特刊揭露的「獨家/起底!寶和會黑網大現形」系列報導。該篇調查報導點名寶和會為目前台灣最大勢力的黑幫組織,並鉅細靡遺的詳述其運作網路與盤根錯節的政商關係。
報導指出,寶和會由竹聯幫和堂綽號「小寶」的邵柏傑創立,該組織靠著放貸、酒店圍事等不當行為壯大,並因涉及2020年震驚社會的「館長」陳之漢槍擊案而受到外界廣泛關注。報導還提及寶和會的勢力已進一步滲透至金融市場,指前會長邵柏傑與上櫃公司「聯合光纖通信」(4903)的前總顧問謝嘉入交情匪淺,兩人不僅涉入聯光通的經營權之爭,更捲入聯光通與上市公司「捷泰精密工業」(6165)的炒股案件,整個黑網組織圖曝光後,引起社會大眾關切,也讓點閱率直線上升。