北院勘驗關鍵證據：編號「A1-37」的行動硬碟，硬碟內存有柯文哲確診簡訊、台大評分總表、對下屬的主觀評價等資料，檢方認為，這些文件具有私密性，且建立者和存檔者都是「Wen」，不可能假手他人，足以認定這些文件都是由柯文哲本人親自存取和建立。
至於最受矚目的「小沈1500」，檢方指控，這就是意旨賄款，由沈慶京親自交款，而柯文哲也確實有收到錢，和柯先前的回答「至少要知道，誰有幫助過我們」相符。
勘驗完畢，辯方卻對使用行動硬碟原物勘驗表示不滿，律師蕭奕弘指出，應該使用image檔作為標的，確保證物完整性，不應該使用原始硬碟，以避免數位證據遭到變動，讓可能的證據鏈被破壞。他更嚴正表示：「『A1-37』中有31萬254個檔案，其中包括1萬5455文件檔、3250個PPT檔，柯文哲沒印象有看過工作簿這個Excel檔，且office作者名只是一個代號，代表電腦名稱，不能以此認定檔案是誰做的、修改的。」
但蕭奕弘提出的質疑卻遭到法官當庭打臉，法官認為，辯方沒有提前表示意見，法院本應終於證據本身，以原物為妥，且為了確保證物不被變更，已請專業資訊人員在旁輔佐。檢方也質疑，辯方既然希望用印象檔勘驗，卻沒有事先提出，法庭氣氛一度劍拔弩張。