蘇打綠與林暐哲決裂後，控訴對方未支付2015年「再遇見」演唱會酬勞，及積欠與騰訊集團相關的視聽、錄音及詞曲著作權費，金額高達新台幣4億7千萬元，刑事部分雖獲不起訴，但民事官司至今仍在纏訟。台北地院民事一審判決林暐哲須賠償2,355萬元，團員強調，若最終獲得賠償，將全數捐出做公益。
自從青峰站出來控訴林暐哲後，在蘇打綠面前，「林暐哲」三個字皆以「那個人」代替，原因就是他帶給團員的創傷太深。據蘇打綠工作人員透露，林暐哲除了金錢問題，過去擔任經紀人與製作人15年間的高壓管理與霸凌，更使團員們普遍出現創傷後壓力症候群，其中主唱吳青峰更因此罹患失聲隱疾。
青峰前幾年就提及自己的聲音狀況不穩定，更在高雄演唱會上提及「退休計畫」。2019年時，他因官司纏身及壓力過大，在個人演唱會時就曾出現聲音異常；2022年以「魚丁糸」名義重返小巨蛋，更曾突發「一夜失聲」。親友透露，這些病症皆與長期壓力相關。
蘇打綠與林暐哲決裂後，內部陸續揭露不少往事，包括合約不公、團員收入分配不均及人際離間等爭議。據悉，團員多年來版稅僅能分得10%，平均每人僅有1.67%。阿福更曾在2017年受訪坦言，成軍16年存款不到200萬元。直至2020年首次獨立與唱片公司合作，6人分得80萬元版稅，仍驚訝到以為「算錯」。
青峰過去曾被林暐哲視為愛徒，卻在師徒決裂後成為主要訴訟對象，青峰從2019年開始，一連接到林暐哲的7項訴訟，甚至連媽媽都因為擔任其工作室負責人也一同被告，所幸最後全部勝訴。青峰原以為在林暐哲待他如父，沒想到對方卻利用知遇之情，不斷向他予取予求。
據悉，林暐哲過往對團員都是高壓政策，包括曾在蘇打綠演唱會開演前2小時臨時改流程，青峰認為這樣不妥，竟遭當場痛罵：「你以為你是誰、了不起是不是？」讓敏感的他躲到會場角落獨自哭了半小時，後來才被工作人員找到讓他登台演出。
小威請工作人員代買便當，也被斥責是大頭症，馨儀則是長期擔任樂團行政，處理一堆報帳、訂錄音室等瑣事，但1個月只給她1萬8千元的「薪水」，比最低工資還少。
2016年，蘇打綠於金曲獎大放異彩後，林暐哲突宣布「休團3年」，實際盤算要推動最賺錢的青峰單飛。當青峰提出想休息，林暐哲便以訴訟為手段拿走，並早將「蘇打綠」三字註冊為己有。2017年，阿福受訪時透露，當時已經成軍16年的蘇打綠，團員每人的存款可能都不到200萬元，因為蘇打綠和林暐哲的合約從來沒變過，連版稅都只能拿到百分之十，平均一個人只有百分之1.67。
另外，曾有主辦單位因為幫蘇打綠辦演唱會賺到錢，包給林暐哲100萬紅包，讓他在過年辦慶功宴時給員工們抽獎，但最後這筆錢並未出現在尾牙上，團員們則是在多年後才聽聞。尤其林暐哲並未認為自己有錯，種種行徑讓團員傷透心。