馬英九今於董事會上首先表示，上個月底才開過第三屆第三次的董事會，今天4月13日，才過了17天，怎麼又要召開臨時董事會呢？是因為基金會準備要提案增聘新董事，依法必須經過董事會同意。
馬英九說，雖然今天的董事出席人數未達法定人數，無法成會，但今天這場臨時董事會，是他個人決定要召開的，因為這場會議真的是很重要。
馬英九指出，今天召開的臨時董事會主要有2個目的。第一，他指示董事會要新聘4位董事，這4位董事的人選中，有2位是基金會的創會董事廖繼斌、戴遐齡，「基金會成立初期的艱辛過程，他們最清楚」。
此外，也有2位新面孔，分別是前陸委會主委賴幸媛以及前國健署署長邱淑媞。馬英九指出，這2位人選都是他過去擔任8年總統任內，派任行政院的首長，新聘的4位董事才德兼備，公共事務經驗豐富，希望借重他們多元的聲音與豐富的行政經驗，能夠在董事會中發揮影響力，希望董事會能夠全力支持。
馬英九表示，第二，是要請蕭旭岑、王光慈2位涉嫌違反財政紀律案的三人調查小組，把案件的調查進度說明清楚，案件查到哪裡，就講到哪裡，讓證據來說話，實話實說，不要隱瞞。基金會過去這段時間發生的一些違反財政紀律案件，一定要調查清楚，應該秉持「勿枉勿縱」、「公平公正」的精神；雖然2位當事人均已離職，但不能鄉愿、息事寧人，「如果當事人沒有犯錯，我們就應該還他們清白，如果當事人有犯錯，就應該把事情徹底調查清楚」。
馬英九強調，這關乎到他一生最重視的清廉操守，他從政不論是8年台北市長或8年的中華民國總統都是如此。他要再一次強調，馬英九基金會成立是為了公益，不是馬英九個人的基金會，董事長和所有員工都不能做出違反基金會成立目的的事，更不能藉基金會的名義謀私利。
「這件事情就是單純的整頓基金會內部財政紀律的問題，我決不容忍有人違法。」馬英九也說明，這是基金會內部的公務，他要特別聲明，他的妻子周美青從來不介入他的公務，其他家人不能、也不會介入他的公務。
馬英九說，這一個多月來，媒體對基金會的報導很多內容與事實不符，他簡單還原事發經過。他在今年1月中發現基金會運作已經產生重大財政紀律問題，這令他痛心疾首，因為「清廉」是做人做事最基本的原則。
馬英九接著指出，因此他才主動找到基金會董事高華柱、舊屬金溥聰商量解決之道，後來才在2月25日召開會議，並要求蕭旭岑、王光慈兩位同仁辭職。隨後他指示會計師與金溥聰報告調查結果。
馬英九也強調，外界針對基金會整頓內部紀律的報導與評論，有許多不符事實的內容，為了澄清真相，以正視聽，他特別請金溥聰代表他，必要時主動出面跟外界作說明。
