北市府近日質疑，行政院主計總處擴大解釋一般性補助款「總額不變」，藉此砍個別縣市一般性補助款。為此，蔣萬安今天上午列席行政院會前批評，一般性補助款和計畫性補著款性質不同，長期以來都有公正公開方式，行政院卻擴張解釋，在對地方政府補助總額不變的前提下，中央可以調整對各縣市的補助金額。
行政院發言人李慧芝今天上午主持政院院會會後記者會時轉述，卓榮泰在院會中說明，新版《財劃法》修正後，為避免影響國防、外交、經濟政策，政府不得不做必要調整，但中央明年度挹注各地方的各項財源不會低於今年，且是歷史新高，待確保調整後，屬於地方的教育、社福等基本設施都可以維持。
另外，卓榮泰提出3項調整，1是重大施政項目，還是中央支應為主；2是中央、地方共同分擔的污水下水道、縣市管道路、漁港下水道、地方藝文等建設原則保留協助50%，但如果地方有困難，還是可以討論；3是地方所屬學校電費、地方公有建設物的耐震改善經費、部分廢棄物清理經費等，回歸地方制度精神。卓也要求，地方對於中低收入戶等弱勢族群需求，應該要從統籌稅款優先支應，避免影響弱勢族群。
卓榮泰強調，政院對申請案或是計畫型補助款都是考量如何均衡台灣，如何協助財政級距比較差的縣市，從未有政治性考量，縣市首長可以放心。