根據《鏡週刊》報導，林佳龍接任外交部長後，國安團隊互動出現怪象，例如國安會有些會議會把林佳龍「擋在門外」，直接通知外交部內的單位前來開會；外交部也有手段反制，像是把送交國安會的外交電報經過篩選，「從原本厚厚一疊，變少少幾張」。
報導指出，龍燮鬥在對美關係上較勁激烈，台美政府高層每年重要的「特殊管道」對話，是雙方討論安全議題的重要平台，2023年、2024年會議都是由國安會秘書長、外交部長共同赴美，但今年外交部卻差點掉隊，最後經過林佳龍出手爭取，才讓外交部次長陳明祺趕上前往美國。
此外，龍燮鬥角力也延伸到人事上，吳釗燮今年上半年在未告知林佳龍的情況下，透過北美司向美方諮詢駐美代表人選由徐斯儉接任的可能性，但此事不僅在北美外交圈傳得沸沸揚揚，還傳進現任駐美代表俞大㵢耳裡，此舉讓林佳龍系統大為訝異、憤怒，最後出動賴清德親自解決，並找上林、吳二人當面溝通，若無其他變數，年底前不會動俞大㵢。
報導提到，除了特殊管道對話安排不順、徐斯儉駐美風波外，10月初《日經亞洲》報導，國安會副秘書長趙怡翔訪問華府，探詢賴今年出訪中南美、過境美國的可能，趙怡翔是吳釗燮一力提拔的子弟兵，隨後就有「涉外人士」痛批趙怡翔繞過代表處、衝擊台美互信等新聞，儼然龍燮雙方公然在媒體上較勁。
