海巡署第四海巡隊初步調查，17日晚間7時，兩艘遊艇從台南安平漁港報關出港，計畫前往澎湖七美海域海釣，其中一艘船由50歲的吳姓男子駕駛，船上載有一名莊姓釣客。
航行途中，同行的另一艘海釣船發現吳男駕駛的「13號咖啡遊艇」消失在視線中，且超過預定返港時間仍未現蹤。同行人員嘗試透過無線電及手機聯繫吳男與莊男均無回應。因擔心發生意外，同行船隻隨即通報海巡署請求協助搜尋。
18日上午11時，海巡署第四海巡隊接獲民間漁船通報，指稱在曾文溪出海口、七股外海約7海里處的海面上，發現一具男屍在海中漂浮。打撈上岸後從遺體身上資料，確認死者是失聯的50歲吳姓船長，海巡隊已報請台南地檢署相驗，確認具體死因。
第四海巡隊組主任王榮吉表示，「13號咖啡遊艇」及莊姓釣客仍下落不明，巡防艇將在尋獲遺體的海域周邊密集巡邏，並將視海象狀況調整搜索範圍。對於船隻失聯的確切原因，是因遭遇大浪導致翻覆，或有其他因素導致人員落海，目前尚無法斷定。
