中選會說明，全國性公民投票電子連署系統已於2024年4月10日上線，2025年受理全國性公民投票案4案，估計超過40萬連署人次使用該系統完成連署，連署期間系統運作情形良好。公民投票案件數及提案內容於本會全球資訊網公民投票專區均有清楚、即時的公開。
中選會指出，2025年中選會受理全國性公民投票案4案，包括廢止《憲法訴訟法》門檻、廢止罷免提議需附身分證影本、廢止罷免連署需附身分證影本，以及廢止罷免偽造需另科罰金，均進入徵求連署階段，據提案人之領銜人自行公開之徵求連署資料，4案採電子連署人數總計超過40萬人次，因未達連署門檻，未向本會提出連署人名冊。
中選會續指，為使民眾及提案人之領銜人均能瞭解全國性公民投票提案及連署情形，已於該會全球資訊網建置「全國性公民投票專區」，包括全國性公民投票電子連署系統介紹、操作說明、公投簡介、法規、提案及連署受理情形、投票結果、聽證會、意見發表會、公民投票公報等內容。
中選會提到，台北市公民投票提案及連署電子系統係依《台北市公民投票自治條例》及其相關作業辦法辦理，迄今未曾有提案進入徵求連署階段，又該系統係限於台北市民使用，與全國性公民投票電子連署系統提供全體國民使用，適用範圍不同。
中選會強調，自2018年公民投票法修正，賦予該會建置全國性公民投票電子連署系統法源依據後，本會積極辦理全國性公民投票電子連署系統之系統建置、資安檢測、穩定性測試、維運、雲端資料中心租用等各項作業，以落實執行法定義務，未曾有浪費公帑情形。
