丹娜絲颱風於7月6日自嘉義布袋鎮登陸，由南往北橫掃台灣西部，最大陣風超過17級，暴風圈籠罩雲嘉南逾4小時；7月28日西南氣流又帶來劇烈強降雨，高雄多納林道單次累積雨量高達3073公釐，打破歷史紀錄。兩波災害造成房屋損毀逾4.3萬戶、電線杆毀損逾3500支，電力、通訊、農業設施、道路與水利系統全面受創，重創民生經濟。
外界批評中央救災動作遲緩，行政院直到7月30日緊急成立「114年7月颱風豪雨雲嘉南災後復原前進指揮所」，由政務委員陳金德擔任指揮官、行政院顧問李孟諺為副指揮官，整合內政部、行政院災防辦、農業部、水利署等單位，每週開會兩次全力推動復原重建。
15日上午10點，雲嘉南復原前進指揮所召開重要協調專案會議，水利署長親自坐鎮，內政部、環境部、經濟部、農業部也指派次長出席，現場聚集多名簡任或首長級官員，王原定親自簡報。豈料，她在得知副總統蕭美琴將出席同日位於高雄的「國家防災日」記者會後，臨時取消會議行程，把重建會議交由一名「聘用助理研究員」代打，簡報任務更轉交農業部農水署。
值得注意的是，這已非王怡文首次在重大災情期間「人不在位」。民眾黨立委張啟楷12日在立院專案報告質詢時痛批，丹娜絲颱風與七二八豪雨防救階段，災防辦主任竟以公務名義出國參加APEC會議，當時嘉義、台南災民屋頂還沒修好、垃圾未清理，中央防救災最高層卻不在第一線，「設災防辦是做什麼用的？」
知情人士進一步爆料，王怡文赴韓實際只是參加一場APEC會議講座，行程安排在7月31日一天，卻以公費停留當地五天四夜（7月29日至8月2日）才返台，形同變相旅遊。而王怡文接連兩次在風災關鍵期錯估優先順序，引起各界質疑災防辦危機處理能力，恐進一步削弱民眾對政府防災體系的信任。